Molekularna destilacijaje posebna tehnologija odvajanja tekućina-tekućina, koja se razlikuje od tradicionalne destilacije koja se oslanja na princip odvajanja razlike u vrelištu. Ovo je proces destilacije i pročišćavanja materijala osjetljivog na toplinu ili materijala s visokim vrelištem koristeći razliku u slobodnom putu molekularnog gibanja pod visokim vakuumom. Uglavnom se koristi u kemijskoj, farmaceutskoj, petrokemijskoj industriji, industriji začina, plastike i nafte te drugim industrijskim područjima.
Materijal se prenosi iz posude za punjenje u isparivač s omotačem glavne destilacije. Rotacijom rotora i kontinuiranim zagrijavanjem, materijalna tekućina struže se u izuzetno tanak, turbulentan tekući film i gura prema dolje u obliku spirale. U procesu spuštanja, lakši materijal (s niskim vrelištem) u materijalnoj tekućini počinje isparavati, kretati se do unutarnjeg kondenzatora i postati tekućina koja teče dolje do tikvice za primanje lake faze. Teži materijali (poput klorofila, soli, šećera, voska, itd.) ne isparavaju, umjesto toga teče duž unutarnje stijenke glavnog isparivača u tikvicu za primanje teške faze.